Научная библиотека имеет 6 филиалов, расположенных в подразделениях ЯНЦ СО РАН. Представленная в филиалах литература преимущественно соответствует направлениям научной работы, осуществляемой сотрудниками институтов.
Заведующая: Решетникова Наталья Михайловна
Заведующая: Николаева Татьяна Васильевна
Научная библиотека является вспомогательным подразделением, основной задачей которой является оперативное информационно-библиотечное обеспечение научно-исследовательской деятельности сотрудников Института с использованием традиционных информационно-библиотечных методов работы и электронных технологий, организация тематических выставок и выставок новых поступлений. Услугами библиотеки пользуются сотрудники Института, преподаватели и аспиранты СВФУ им. М.К. Аммосова и представители различных организаций города и республики. Библиотечный фонд насчитывает около 20000 экземпляров книг. В фонде библиотеки широко представлена литература по историческим (археология, этнография, история Сибири и Дальнего Востока) и филологическим наукам (языкознание, литературоведение, фольклористика).
Научная библиотека Якутского научно-исследовательского института сельского
хозяйства имени М. Г. Сафронова
677001, г. Якутск, ул. Бестужева-Марлинского 23/1, каб. 316
Заведующая: Яковлева Варвара Иннокентьевна
Библиотека была организована в 1956 году, после объединения Булунской, Тиксинской, Сергеляхской животноводческой, Якутской ветеринарной, Покровской селекционной опытных станций и Алданского опорного пункта в Якутский научно-исследовательский институт сельского хозяйства. Объем фонда составляет около 50-ти тысяча единиц хранения научной, научно-популярной, научно-методической литературы по ветеринарии, животноводству, растениеводству, почвоведению, земледелию, экономике, строительству, механизации и автоматизации сельского хозяйства. Создается электронный каталог, генерируются собственные базы данных: база данных книг, материалов конференций, продолжающихся изданий; полнотекстовая БД статей сотрудников ЯНИИСХ; БД авторефератов диссертаций.
Научная библиотека Института горного дела Севера им. Н. В. Черского
677980, г. Якутск, пр. Ленина, 43
Заведующая: Ремигайло Наталья Николаевна
В настоящее время фонд насчитывает около 20 тысяч различных документов: книги (в том числе на электронных носителях), научно-технические журналы горного профиля (в основном с 1981 года), стандарты, каталоги, патенты, рукописи (научно-технические и хоздоговорные отчеты, различные методики и рекомендации сотрудников Института, а также диссертационные работы, защищенные в диссертационном совете при ИГДС СО РАН).
Научная библиотека Института космофизических исследований и
аэрономии им. Ю.Г. Шафера
677980, г. Якутск, пр. Ленина 31, 2 этаж
Заведующая: Самсонова Лариса Мироновна
Библиотека комплектуется в соответствии с тематикой научно-исследовательских работ Института. В настоящее время библиотека имеет большой фонд научной литературы – более пятидесяти тысяч документов, в том числе более пятнадцати тысяч иностранных. Особое место занимают Труды международных конференций, которые привозят с собой и сдают в библиотеку участники этих научных форумов. Выделены отдельно сборники трудов ИКФИА, «Резервно-страховой фонд» и архив Ю.Г.Шафера